Le exanthème des mains pieds et bouche ou une éruption cutanée est généralement résolu en une semaine. Seuls quelques cas d’entérovirus 71 sont compliqués d’encéphalite ou de pneumonie. Parfois, Coxsackie A16 est associé à des lésions cutanées récurrentes et chroniques.

Les complications sont rares et généralement cutanées: chute d’ongles, desquamation des doigts, de la paume des mains ou de la plante des pieds, ou eczéma coxsackium, qui est une forme plus grave de maladie chez les enfants qui ont déjà une peau endommagée par la dermatite atopique. Il peut y avoir une surinfection par les bactéries de la peau. Des cas de myosite (inflammation musculaire) avec élévation des enzymes musculaires (CPK) ont été décrits dans les épidémies.

La prévision de la maladie mains pieds et bouche il est bon dans la grande majorité du temps, sauf dans les formes compliquées d'entérovirus 71, pouvant évoluer en cas d'œdème pulmonaire ou de complications d'encéphalite: coma, convulsions, difficultés de la démarche, tremblements, séquelles neurologiques à long terme ou même la mort.

Le taux de mortalité lors d’une épidémie à Taiwan touchant 20% des enfants en 1998 était inférieur à 1 patient sur 1000.

Sa mère a réalisé une grave erreur - ce garçon avait une forte fièvre et n'arrêtait pas de pleurer (Août 2019).