À diagnostiquer le SIBO o Prolifération bactérienne de l'intestin grêle le plus important est de le soupçonner. Toute personne présentant des symptômes digestifs tels que ceux décrits peut avoir un SIBO associé ou non à une autre pathologie digestive ou systémique. Il est important de dresser un historique médical complet, y compris les médicaments que prend la personne ou les symptômes liés à la consommation de différents aliments, en plus d'un examen physique approfondi.

SIBO peut être suspecté dans certaines situations, par exemple en cas d'amélioration insuffisante chez les patients coeliaques qui suivent un régime sans gluten. Aussi, si les symptômes digestifs s'aggravent lorsqu'ils reçoivent des probiotiques, des prébiotiques ou un régime riche en fibres. Dans d'autres cas, on soupçonne une amélioration transitoire des symptômes digestifs après la prise d'antibiotiques ou une aggravation avec des médicaments tels que des opioïdes ou des protecteurs gastriques.

Le diagnostic de SIBO aujourd’hui se fait principalement avec l’alcootest ou test d'air expiré pour la prolifération bactérienne. Chez une personne en bonne santé, l'hydrogène et le méthane ne sont produits que dans le gros intestin, mais dans le cas du SIBO, ils le sont également dans l'intestin grêle. Le test consiste à administrer du lactulose ou du lactitol et à mesurer l'hydrogène et le méthane dans l'haleine.

Dans des conditions normales, ces sucres ne sont pas absorbés dans l'intestin grêle et doivent atteindre le gros intestin. Si le test est positif avec deux pics ou un pic précoce des concentrations d'hydrogène et de méthane dans l'air exhalé, il est considéré positif pour SIBO car il indiquerait la présence de bactéries qui fermentent le lactulose dans l'intestin grêle. Pour effectuer le test, une série de recommandations précédentes doit être strictement suivie.

Ce test peut comporter de nombreux faux négatifs et, moins fréquemment, des faux positifs. Si le test SIBO est toujours suspect avec un test négatif, un aspirat jéjunal avec culture du fluide obtenu peut être répété ou réalisé par endoscopie. Une autre option consisterait à effectuer un traitement empirique et à observer la réponse.

Outre le diagnostic de SIBO, il est important de rechercher la cause de la prolifération bactérienne et de prendre en compte le fait qu'un patient atteint de SIBO peut avoir plusieurs causes concurrentes. La maladie cœliaque, l'hypochlorhydrie gastrique, la présence de giardiase et l'intestin irritable avec altération du complexe moteur migratoire sont particulièrement fréquents.

Small Intestinal Bacterial Overgrowth test collection - Genova Diagnostics (Août 2019).